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Kenya
Le Kenya s'est imposé en tête des nations africaines avec 11 médailles, dont 4 en or, 5 en bronze et 2 en argent, toutes remportées en athlétisme. Le pays, connu pour ses performances en moyenne et longue distance, a une fois de plus confirmé sa réputation. Hellen Obiri et Benson Kipruto ont décroché le bronze dans les marathons respectifs, malgré la déception liée à l'abandon d'Eliud Kipchoge. En 5000 m, Ronald Kwemoi et Faith Kipyegon ont remporté l'argent, tandis que Kipyegon s'est aussi illustrée avec l'or au 1500 m féminin. Béatrice Chebet a dominé le 5000 m et le 10 000 m, et Emmanuel Wanyonyi a décroché l'or au 800 m.
L'Algérie
L'Algérie a également marqué ces jeux avec la gymnaste Kaylia Nemour, première Africaine à remporter l'or aux barres asymétriques. Imane Khelif, malgré la controverse sur son genre, a gagné l'or en boxe dans la catégorie des -66 kg. Djamel Sedjati a ajouté une médaille de bronze au 800 m hommes.
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L'Afrique du Sud
L'Afrique du Sud a obtenu six médailles, notamment grâce à la nageuse Tatjana Smith, championne olympique au 100 m brasse et médaillée d'argent au 200 m brasse. La nation a aussi remporté des médailles en relais 4x100 m hommes, au lancer de javelot femmes pour Jo-Ane van Dyk, et Alan Hatherly a décroché une médaille en cross-country masculin.
L'Éthiopie
L'Éthiopie, avec quatre médailles, se classe quatrième. Tamirat Tola a remporté l'or au marathon hommes, battant le record mondial établi par Samuel Kamau Wanjiru. Les autres médailles éthiopiennes ont été obtenues par Berihu Aregawi au 10 000 m hommes, Tsige Duguma au 800 m femmes, et Tigst Assefa, deuxième au marathon femmes.
L'Égypte
L'Égypte ferme le top 5 africain avec trois médailles. Mohamed Elsayed a remporté le bronze en épée, Ahmed Elgendy l'or au pentathlon moderne, et Sara Ahmed a gagné l'argent en haltérophilie, catégorie des -81 kg.
La Tunisie
La Tunisie a brillé en taekwondo avec l'or de Firas Katoussi dans les -80 kg et le bronze de Mohamed Khalil Jendoubi dans les -58 kg. Fares Ferjani a remporté l'argent au sabre individuel.
L'Ouganda
L'Ouganda, bien que n'ayant remporté que deux médailles, a vu Joshua Cheptegei décrocher l'or au 10 000 m, et Peruth Chemutai l'argent au 3000 m steeple féminin.
Le Botswana
Le Botswana a également fait forte impression avec deux médailles, dont l'or de Letsile Tebogo au 200 m, premier Africain à remporter l'or sur cette distance. Tebogo a aussi contribué à l'argent au relais 4x400 m hommes.
Le Maroc
Le Maroc quitte ces Jeux avec deux médailles, dont l'or de Soufiane El Bakkali au 3000 m steeple hommes et le bronze de l'équipe de football masculine.
Enfin, le Cap Vert, la Zambie et la Côte d'Ivoire ont chacune remporté une médaille de bronze dans leurs disciplines respectives, la boxe, le 400 m hommes et le taekwondo.